福州市马尾区琅岐岛的闽江马尾对台综合客运码头与马祖南竿的直线距离为18海里。从此码头前往马祖的海上航程仅需45分钟，并可经马祖前往台湾岛多个城市。该码头建设三个泊位及其相应配套设施，其中1号泊位为5000吨级客货泊位，年货物通过能力25.2万吨，年旅客通过能力3.3万人次；2号与3号泊位为2个500吨级客运泊位，年旅客通过能力53.1万人次。
福州火车南站是中国铁路南昌局集团有限公司管辖的一等站，是中国十大区域性铁路客运交通枢纽之一，是福建省最重要的综合交通枢纽，也是福州市对外开放的重要门户。福州南站总建筑面积19.7万平方米，旅客候车面积21744平方米，于2010年投入使用。
